Le bureau de l’association des Journées internationales d’histoire (JIH) de Flaran se charge chaque année de l’organisation scientifique et matérielle des colloques. Il lui revient d’en déterminer les sujets parmi les questions connaissant un renouvellement historiographique important ou bien peu abordées, sinon de manière éparse, par les historiens du Moyen Age et de l’époque moderne.
Le bureau choisit ensuite des directeurs scientifiques, reconnus pour leur compétence en la matière, qui établissent un programme, soumis à validation, mêlant rapports (bilan d’une question à l’échelle européenne) et communications (études de cas). Une attention particulière est portée à l’équilibre entre les périodes mais aussi à la présence de chercheurs étrangers.
Il est tout à fait possible de proposer au bureau un thème qui pourrait donner lieu à un colloque.